Năm 1999 có thể xem là bước ngoặt trên con đường ca hát của chị khi hát chung cùng ca sĩ Đan Trường và trở thành cặp song ca ăn khách nhất. Từ 2001-2004, Cẩm Ly được bình chọn là một trong mười ca sĩ được yêu thích nhất của chương trình Làn sóng Xanh. Hiện chị là ca sĩ độc quyền của Kim Lợi studio và là một trong những nữ ca sĩ có sức sống bền bỉ trong lòng khán giả yêu ca nhạc, bởi không chỉ thể hiện thành công những ca khúc nhạc trẻ mà chị còn nổi bật khi thể hiện những ca khúc mang âm hưởng dân ca, trữ tình.

Tuy là ca sĩ chính hiệu nhưng khi nghe Minh Thuận mời vào vai Lan trong vở ca kịch cải lương Chuyện tình Lan và Điệp, Cẩm Ly không ngần ngại nhận lời, tuy biết cải lương không phải dễ hát, ngoài việc tập tành nghiêm túc còn phải biết nhấn nhá theo tình huống của kịch bản mà đặc biệt là phải có… hơi dài thì mới mong hát cải lương được. Vốn yêu thích tuồng Lan và Điệp từ hồi còn bé, Cẩm Ly đã bỏ 6 tháng liền để tập luyện cùng ê kíp ca sĩ của vở diễn, đêm nào cũng tập từ 11 giờ tối đến 3 giờ sáng hôm sau. Chị cho biết lúc đầu cũng lúng túng trong việc vào, ra vai, quên lời thoại nhưng nhờ niềm đam mê nghệ thuật cải lương đã giúp chị kiên nhẫn và tập luyên nghiêm túc.